爱沙尼亚具有市镇地位的城市数量为15个。2018年初时城市的总人口数量为810,433人。只有最大的城市塔林有超过十万名居民。居民数量在三万至十万之间的城市有四个：塔尔图市、纳尔瓦、派尔努和科赫特拉-耶尔韦。